總持寺の守護神は荒神様（三寶大荒神）です。

總持寺三世太源宗真禅師（普蔵院開基）の成徳道風を敬慕した難陀竜王が禅師の血脈（禅師の法戒）を授けられた。そのお礼に荒神を奉納したと伝えられます。禅師は、これを受けて当本山の鎮護の神として、永久に仏・法・僧の三宝を守護する三寶大荒神として祀られたことに由来します。

身体健全・心願成就・交通安全・合格祈願などの祈祷を行っています。